Bioinformatico, con background Informatico, dal 1994 sono membro del gruppo di Bioinformatica di Bari del CNR. Le mie attività sono focalizzate nell’ambito del Research Data Management (RDM). Esperto in organizzazione dati e costruzione di database e strumenti per l’integrazione di dati omici; esperto in strumenti e ontologie per la standardizzazione di dati e metadati secondo i principi FAIR. Competenze in sviluppo di pipeline per l'analisi di dati trascrittomici, in particolare di non-coding RNA, in diverse specie. Esperto in gestione di data center e piattaforme Cloud e HPC per l'archiviazione, elaborazione e fruizione di dati appartenenti alle Scienze della Vita. Autore di più di 50 pubblicazioni in riviste internazionali con peer-review ed ha partecipato a più di 20 progetti internazionali e nazionali.
Partecipo attivamente alle attività:
- dell’infrastruttura europea ELIXIR (ESFRI) per la gestione ed analisi di dati in ambito Life Science, in particolare per il nodo italiano ELIXIR-IT è co-leader della piattaforma Interoperability e della Research Data Management community e Local Technical coordinator per CNR-Bari; il sottoscritto è responsabile della infrastruttura computazionale (CNR.BiOmics) del CNR dedicata alla gestione, conservazione ed analisi di dati e applicazioni parte della piattaforma Compute di ELIXIR-IT.
- del gruppo di lavoro sulla organizzazione delle Biobanche Pugliesi per la crio-conservazione del materiale biologico istituito dall’AReSS-Regione Puglia
Attività di Ricerca
Profilazione trascrittomica per biomarcatori di RNA codificanti e non‑codificanti e analisi di pathway regolatori.
Sviluppo di strumenti bioinformatici per l'analisi di Big Data.
Sviluppo, applicazione e ottimizzazione di pipeline automatizzate per l'analisi di dati genomici, epigenomici e trascrittomici per studi su larga scala.
Implementazione e applicazione di pipeline di analisi automatizzate per l'analisi di dati di trascrittomica di massa, single-cell e spaziali.
Sviluppo e implementazione di database/portali
Gestione e armonizzazione dei dati biomedici attraverso l'organizzazione, la cura e l'integrazione di set di dati eterogenei di salute e ricerca in formati standardizzati.
