Trascrittomica

Presso l'Istituto di Tecnologie Biomediche, un team dedicato di ricercatori svolge attività avanzate di trascrittomica volte a sezionare l'espressione genica e i meccanismi regolatori in condizioni di salute e malattia. Il gruppo applica approcci trascrittomici all'avanguardia all'analisi di cellule tumorali, cellule staminali, organoidi e tessuti umani e murini in modelli di malattia, con particolare attenzione alla scoperta di biomarcatori e alla caratterizzazione dei pathway regolatori che coinvolgono sia RNA codificanti che non codificanti. Il team studia anche i trascrittomi delle vescicole extracellulari (EV), inclusi esosomi e microvescicole, per identificare biomarcatori di malattia e supportare il monitoraggio della malattia e della terapia. A complemento di questi sforzi, i ricercatori forniscono competenze nella preparazione di campioni e librerie per il sequenziamento ad alto rendimento, che comprende flussi di lavoro di RNA bulk, a singola cellula e a piccoli RNA/non codificanti, e conducono analisi approfondite della plasticità del trascrittoma nel cancro, inclusi trascritti di fusione e RNA circolari. Tecnologie di sequenziamento a lettura lunga all'avanguardia vengono impiegate per risolvere isoforme trascrizionali, eventi di splicing complessi e varianti strutturali. Inoltre, il team esplora il ruolo delle modificazioni del tRNA e dei frammenti derivati ​​dal tRNA nella regolazione della traduzione, dell'autorinnovamento e della differenziazione delle cellule staminali, nonché della trascrittomica batterica e delle interazioni ospite-patogeno, contribuendo a una comprensione completa della regolazione trascrizionale nei sistemi biologici.