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Di Nanni N.; Gnocchi M.; Moscatelli M.; Milanesi L.; Mosca E.
Gene relevance based on multiple evidences in complex networks
(2020) in Bioinformatics (Oxf., Online)
Mezzelani, A.; Cupaioli, F. A.; Mosca, E.; Magri, C.; Gennarelli, M.; Raggi, M. E.; Landini, M.; Galluccio, N.; Chiappori, F.; Moscatelli, M.; Gnocchi, M.; Villa, C.; Molteni, M.; Bonfanti, A.; Ciceri, F.; Marabotti, A.; Milanesi, L.
Association of Haptoglobin-1 allele with Autism
(2019) in European journal of human genetics
Di Nanni, Noemi; Moscatelli, Marco; Gnocchi, Matteo; Milanesi, Luciano; Mosca, Ettore
isma: an R package for the integrative analysis of mutations detected by multiple pipelines
(2019) in BMC bioinformatics
Maccaferri M, Harris NS, Twardziok SO, Pasam RK, Gundlach H, Spannagl M, Ormanbekova D, Lux T, Prade VM, Milner SG, Himmelbach A, Mascher M, Bagnaresi P, Faccioli P, Cozzi P, Lauria M, Lazzari B, Stella A, Manconi A, Gnocchi M, Moscatelli M, Avni R, Deek J, Biyiklioglu S, Frascaroli E, Corneti S, Salvi S, Sonnante G, Desiderio F, Marè C, Crosatti C, Mica E, Özkan H, Kilian B, De Vita P, Marone D, Joukhadar R, Mazzucotelli E, Nigro D, Gadaleta A, Chao S, Faris JD, Melo ATO, Pumphrey M, Pecchioni N, Milanesi L, Wiebe K, Ens J, MacLachlan RP, Clarke JM, Sharpe AG, Koh CS, Liang KYH, Taylor GJ, Knox R, Budak H, Mastrangelo AM, Xu SS, Stein N, Hale I, Distelfeld A, Hayden MJ, Tuberosa R, Walkowiak S, Mayer KFX, Ceriotti A, Pozniak CJ, Cattivelli L
Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets
(2019) in Nature genetics (Print)
Maccaferri, Marco; Harris, Neil S.; Twardziok, Sven O.; Pasam, Raj K.; Gundlach, Heidrun; Spannagl, Manuel; Ormanbekova, Danara; Lux, Thomas; Prade, Verena M.; Milner, Sara G.; Himmelbach, Axel; Mascher, Martin; Bagnaresi, Paolo; Faccioli, Primetta; Cozzi, Paolo; Lauria, Massimiliano; Lazzari, Barbara; Stella, Alessandra; Manconi, Andrea; Gnocchi, Matteo; Moscatelli, Marco; Avni, Raz; Deek, Jasline; Biyiklioglu, Sezgi; Frascaroli, Elisabetta; Corneti, Simona; Salvi, Silvio; Sonnante, Gabriella; Desiderio, Francesca; Mare, Caterina; Crosatti, Cristina; Mica, Erica; Ozkan, Hakan; Kilian, Benjamin; De Vita, Pasquale; Marone, Daniela; Joukhadar, Reem; Mazzucotelli, Elisabetta; Nigro, Domenica; Gadaleta, Agata; Chao, Shiaoman; Faris, Justin D.; Melo, Arthur T. O.; Pumphrey, Mike; Pecchioni, Nicola; Milanesi, Luciano; Wiebe, Krystalee; Ens, Jennifer; MacLachlan, Ron P.; Clarke, John M.; Sharpe, Andrew G.; Koh, Chu Shin; Liang, Kevin Y. H.; Taylor, Gregory J.; Knox, Ron; Budak, Hikmet; Mastra...
Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets
(2019) in Nature genetics (Print)
Matteo Gnocchi, Marco Moscatelli, Alessandra Mezzelani
GEMMA EU PROJECT INFRASTRUCTURE
(2019)
Matteo Gnocchi,Marco Moscatelli, Alessandra Mezzelani
www.gemma-project.eu
(2019)
Moscatelli, Marco; Manconi, Andrea; Pessina, Mauro; Fellegara, Giovanni; Rampoldi, Stefano; Milanesi, Luciano; Casasco, Andrea; Gnocchi, Matteo
An infrastructure for precision medicine through analysis of big data
(2018) in BMC bioinformatics
Mezzelani A, Cupaioli F, Mosca E, Magri C, Gennarelli M, Raggi ME, Landini M, Galluccio N, Chiappori F, Moscatelli M, Gnocchi M, Villa CL, Molteni M, Bonfanti A, Ciceri F, Marabotti A, Milanesi L.
Association of Haptoglobin-1 allele with Autism.
(2018) European Conference of Human Genetics 2018, Milano, Italy, 16/06/2018 - 19/06/2018
Mosca, Ettore; Bersanelli, Matteo; Gnocchi, Matteo; Moscatelli, Marco; Castellani, Gastone; Milanesi, Luciano; Mezzelani, Alessandra
Network Diffusion-Based Prioritization of Autism Risk Genes Identifies Significantly Connected Gene Modules
(2017) in Frontiers in genetics
Di Maio, Velia C.; Cento, Valeria; Lenci, Ilaria; Aragri, Marianna; Rossi, Piera; Barbaliscia, Silvia; Melis, Michela; Verucchi, Gabriella; Magni, Carlo F.; Teti, Elisabetta; Bertoli, Ada; Antonucci, FrancescoPaolo; Bellocchi, Maria C.; Micheli, Valeria; Masetti, Chiara; Landonio, Simona; Francioso, Simona; Santopaolo, Francesco; Pellicelli, Adriano M.; Calvaruso, Vincenza; Gianserra, Laura; Siciliano, Massimo; Romagnoli, Dante; Cozzolongo, Raffaele; Grieco, Antonio; Vecchiet, Jacopo; Morisco, Filomena; Merli, Manuela; Brancaccio, Giuseppina; Di Biagio, Antonio; Loggi, Elisabetta; Mastroianni, Claudio M.; Palitti, Valeria Pace; Tarquini, Pierluigi; Puoti, Massimo; Taliani, Gloria; Sarmati, Loredana; Picciotto, Antonino; Vullo, Vincenzo; Caporaso, Nicola; Paoloni, Maurizio; Pasquazzi, Caterina; Rizzardini, Giuliano; Parruti, Giustino; Craxi, Antonio; Babudieri, Sergio; Andreoni, Massimo; Angelico, Mario; Perno, Carlo F.; Ceccherini-Silberstein, Francesca; Mariani R, Iapadre N, Grimaldi ...
Multiclass HCV resistance to direct-acting antiviral failure in real-life patients advocates for tailored second-line therapies
(2017) in Liver international (Print)
Manconi, Andrea; Moscatelli, Marco; Armano, Giuliano; Gnocchi, Matteo; Orro, Alessandro; Milanesi, Luciano
Removing duplicate reads using graphics processing units
(2016) in BMC bioinformatics
Di Maio, V. C.; Cento, V.; Di Paolo, D.; Aragri, M.; De Leonardis, F.; Tontodonati, M.; Micheli, V.; Bellocchi, M. C.; Antonucci, F. P.; Bertoli, A.; Lenci, I.; Milana, M.; Gianserra, L.; Melis, M.; Di Biagio, A.; Sarrecchia, C.; Sarmati, L.; Landonio, S.; Francioso, S.; Lambiase, L.; Nicolini, L. A.; Marenco, S.; Nosotti, L.; Giannelli, V.; Siciliano, M.; Romagnoli, D.; Pellicelli, A.; Vecchiet, J.; Magni, C. F.; Babudieri, S.; Mura, M. S.; Taliani, G.; Mastroianni, C.; Vespasiani-Gentilucci, U.; Romano, M.; Morisco, F.; Gasbarrini, A.; Vullo, V.; Bruno, S.; Baiguera, C.; Pasquazzi, C.; Tisone, G.; Picciotto, A.; Andreoni, M.; Parruti, G.; Rizzardini, G.; Angelico, M.; Perno, C. F.; Ceccherini-Silberstein, F.Mariani R, Paoloni M, Iapadre N, Grimaldi A, Menzaghi B, Quirino T, Vecchiet J, Bruzzone B, De Maria A, Di Biagio A, Marenco S, Nicolini LA, Picciotto A, Viscoli C, Casinelli K, Monache MD, Lichtner M, Mastroianni C, Aghemo A, Bruno S, Cerrone M, Colombo M, Monforte AD, Danieli E,...
HCV NS3 sequencing as a reliable and clinically useful tool for the assessment of genotype and resistance mutations for clinical samples with different HCV-RNA levels
(2016) in Journal of antimicrobial chemotherapy (Print)
Gnocchi M.(1), Moscatelli M.(1), Alfieri R.(1), Manconi A.(1), Milanesi L.(1)
HIRMA: WEB PORTAL FOR THE MANAGEMENT OF HEPATOCARCINOMA CLINICAL DATA
(2015) BITS 2015, 03/06/2015
Matteo Gnocchi
ITB TR-052015
(2015)
Manconi, Andrea; Manca, Emanuele; Moscatelli, Marco; Gnocchi, Matteo; Orro, Alessandro; Armano, Giuliano; Milanesi, Luciano
G-CNV: A GPU-Based Tool for Preparing Data to Detect CNVs with Read-Depth Methods.
(2015) in Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
Andrea Manconi, Emanuele Manca, Alessandro Orro, Giuliano Armano, Matteo Gnocchi, Marco Moscatelli and Luciano Milanesi
G-CNV: A GPU-based Tool for Preparing Data to Detect CNVs with Read Depth Methods
(2015) in Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
Roberta Alfieri, Maria Mercedes Santoro, Matteo Gnocchi, Marco Moscatelli, Osvaldo Carpina, Cristina Vischi, Claudia Pisano, Valentina De Murtas, Ennio Polill, Francesco Paolo Antonucci, Ivana Maida, Pierluigi Tarquini, Giovanni Garrucciu, Franco Bandiera, Dante Di Giammartino, Diletta Laccabue, Andre Olivani, Vanni Borghi, Tiziana Quirino, Ilaria Lenci, Giuseppe Tisone, Mario Angelico, Cristina Mussini, Giuliano Rizzardini, Massimo Temponi, Giustino Parruti, Maria Stella Mura, Francesca Ceccherini-Silberstein, Carlo-Federico Perno, Luciano Milanesi
A Web Portal for Clinical and Genotype Data Management for the Study of Hepatocellular Carcinoma; Workshop "Innovation in HIV and Viral Hepatitis
(2015) Beyond viral undetectability: new frontiers and strategies, Milano, 26-27 gennaio 2015
Marco Moscatelli
Matteo Gnocchi
ITB TR-032015
Marco Moscatelli
(2015)
Matteo Gnocchi
Marco Moscatelli
ITB TR-012015
Matteo Gnocchi
(2015)
Matteo Gnocchi
Marco Moscatelli
ITB TR-042015
Matteo Gnocchi
(2015)
Matteo Gnocchi
Marco Moscatelli
ITB TR-022015
Matteo Gnocchi
(2015)
Matteo Gnocchi
cs.bbmri.it
(2015)
Matteo Gnocchi
www.bbmri.it
(2014)
Matteo Gnocchi
www.interomics.eu
(2014)
Alfieri Roberta, Gnocchi Matteo, Moscatelli Marco, Mosca Ettore, Milanesi Luciano.
A Web Portal for Hepatocellular Carcinoma study data management.
(2013) 1° Bioinformatics, computational Biology and System Biology lombardy day BioLom 2013, Milano, 27 novembre 2013
Matteo Gnocchi, Roberta Alfieri, Alessandro Orro, Maria Mercedes Santoro, Ettore Mosca, Daniele Armenia, Francesca Ceccherini-Silberstein, Carlo Federico Perno, Luciano Milanesii
A WEB PORTAL FOR CLINICAL AND GENOTYPE DATA MANAGEMENT FOR THE STUDY OF HEPATOCELLULAR CARCINOMA
(2013) Bioinformatics Italian Society (BITS), Udine, 2013
Lucia Bianchi, Pedro Fernandes, Matteo Gnocchi, Pietro Lio and Luciano Milanesi
IT challenges for Big Data and public health policies in bioP4medicine
(2013) Barcelona developer Conference 2013, Barcellona, 8-10 novembre 2013
Alfieri R(1*), Mosca E(1*), Gnocchi M(1), Lio' P(2), Milanesi L(1)
Integration of transcriptional response and intermolecular interactions in the study of hepatitis C virus-associated liver carcinogenic process
(2013) 10° Annua meeting of the Bioinformatic Italian Society, Udine, 21-23 maggio 203
Silvia Santoro1, Pasqualina D'Ursi1, Nadia Galluccio1, Martina Landini1, Alessandra Mezzelani1, Alessandro Orro1, John Hatton1, Matteo Gnocchi1, Andrea Manconi1 and Luciano Milanesi1*
Bioinformatics molecular dynamics and docking pipeline analysis for high-throughput genome analysis and drug discovery oriented to personalized pain therapy in non-responsive patients.
(2013) Front. Neuroinform. Conference, Stockholm, Sweden, 27-29 agosto 2013
Matteo Gnocchi
https://www.mimomics.it
(2013)
Matteo Gnocchi
Portale Web Istituto di Tecnologie Biomediche
(2012)
Matteo Gnocchi
www.hirma.it
(2012)
Calabria A., Di Pasquale D., Gnocchi M., Cozzi P., Orro A., Trombetti G., Milanesi L.
Grid Powered Genome Wide Studies On Atrial Flutter
(2010) in Journal of grid computing
Bolzacchini E., Ferrero L., Perrone M.G., Lazzati Z., DUrsi P., Orro A., Gnocchi M., Moscatelli M., Milanesi L.
Piattaforma bioinformatica per lo studio della relazione tra particolato atmosferico e salute umana.
(2010) Quarto Convegno Nazionale sul Particolato Atmosferico
Gnocchi M., Orro A., Di Pasquale D., Milanesi L.
A web portal for management of biological data and applications.
(2010) International Worshop on Science Gateways (IWSG2010)
Lazzati Z., D'Ursi P., Orro A., Bolzacchini E., Ferrero L., Sangiorgi G., Perrone M.G., Gnocchi M., Milanesi L.
Analisi in Silico dei Meccanismi dAzione (MOA) correlati allesposizione da Particolato Atmosferico: esame critico del caso del Bisfenolo A.
(2010) Quarto Convegno Nazionale sul Particolato Atmosferico
Orro A., Gnocchi M., Calabria A., Di Pasquale D., Milanesi L.
Genetic Linkage Analysis on the Desktop Grid Infrastructure.
(2010) Third AlmereGrid Desktop Experience Workshop
Gnocchi M., Ronzoni D. and Milanesi L.
Biobanking semantic Multilanguage concepts management web system.
(2010)
Milanesi, L; Calabria, A; Di Pasquale, D; Gnocchi, M; Orro, A; Trombetti, G
A HPC and Grid enabling framework for genetic linkage analysis of SNPs
(2009) in Il Nuovo cimento C (2009, Testo stamp.)
Calabria A., Di Pasquale D., Orro A., Trombetti G., Gnocchi M., Milanesi L.
Genetic linkage analysis challenge on a distributed Grid environment
(2009) in VOGiS Herald
Gnocchi M., Milanesi L.
Genomics and biomedical data management system
(2009) BITS 2009
Calabria A., Di Pasquale D., Orro A., Trombetti G., Gnocchi M., Milanesi L.
Grid Based Application For SNPs Genome Wide Studies
(2009) CIBB 2009, Sixth International Meeting On Computational Intelligence Methods for Bioinformatics And Biostatistics
