Tecnologie Omiche (Bari)

Studio di geni differenzialmente espressi in tumori umani ormono regolati quali tiroide, prostata,endometrio e carcinoma ovarico al fine di identificare possibili nuovi biomarcatori per la diagnosi/ prognosi clinica.

In patologie neurodegenerative quali Sclerosi Multipla, Sclerosi Laterale Amiotrofica, Atrofia Muscolare Spinale: Caratterizzazione del profilo trascrittomico e identificazione di complessi network di co-regolazione miRNA-fattori di trascrizione (FT) . Validazione funzionale in vitro delle correlazioni tra network miRNA-target genici, dei circuiti a feedback e feed-forward miRNA-FT e dei pathway molecolari coinvolti, mediante l’applicazione delle principali metodiche di ingegneria genetica e di biologia molecolare.

Caratterizzazione dei profili molecolari mediante osservazione prospettica longitudinale al fine di identificare biomarcatori idonei per il monitoraggio del trattamento, la risposta individuale e la comparsa di effetti collaterali in pazienti affetti per es. da Atrofia Muscolare Spinale (SMA) e Sclerosi Multipla (SM).

Studio dei profili trascrittomici e proteomici nelle EV (esosomi e microvescicole) isolate da siero e liquido cerebrospinale di pazienti affetti da malattie neurologiche rare mediante l’impiego di tecnologie omiche avanzate. Validazione e analisi funzionale in vitro (saggi reporter, knock-down genico, RNA interference) dei significativi cell-free RNA e proteine vescicolari.

Studio degli effetti dell’assunzione di uva sul metabolismo cellulare umano in soggetti sani sottoposti a una dieta arricchita con uva, varietà Autumn Royal prodotta dal CREA di Turi, tramite analisi trascrittomica di cellule mononucleate del sangue periferico e pathway analysis. Validazione e analisi funzionale dei geni differenzialmente espressi tramite RT-qPCR. Analisi statistica e bioinformatica dei dati e caratterizzazione funzionale delle variazioni del metabolismo cellulare tramite strumenti di analisi funzionale in silico (Gene Ontology, gene and pathway enrichment, gene- e protein-protein interaction network).

Studio degli effetti di micro RNA di piante, assunti tramite la dieta, sulla regolazione dell’espressione genica in cellule tumorali umane tramite trasfezione in vitro e analisi del trascrittoma. Validazione e analisi funzionale tramite RT-qPCR, saggi di proliferazione cellulare, saggi di luciferasi, analisi del ciclo cellulare e apoptosi. Analisi statistica e bioinformatica dei dati e caratterizzazione funzionale delle variazioni del metabolismo cellulare tramite strumenti di analisi funzionale in silico (Gene Ontology, gene and pathway enrichment, gene- e protein-protein interaction network).