Andrea Manconi

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Il Dr. Andrea Manconi ha ottenuto il Dottorato di Ricerca in Ingegneria Elettronica e Informatica presso l'Università di Cagliari. Attualmente è ricercatore presso l'Istituto di Tecnologie Biomediche del Consiglio Nazionale delle Ricerche dove svolge attività di ricerca in ambito bioinformatico. L'attività di ricerca interessa lo sviluppo di soluzioni high-performance- e cloud-based-computing per la bioinformatica. Il Dr. Manconi ha maturato competenze nell'ambito del GPGPU, architetture cloud e intelligenza artificiale.
Il Dr. Manconi è anche membro ordinario della Società Italiana di Bioinformatica (BITS).

Aree di interesse:

Bioinformatica, Deep Learning, Artificial Intelligence, HPC, GPGPU, Cloud computing


Contatti

Telefono: 070-675.8780

Identificatori Internazionali


Prodotti della ricerca

Zampolli, Jessica; Di Canito, Alessandra; Manconi, Andrea; Milanesi, Luciano; Di Gennaro, Patrizia; Orro, Alessandro

Transcriptomic Analysis ofRhodococcus opacusR7 Grown ono-Xylene by RNA-Seq

(2020) in Frontiers in microbiology
Maccaferri M, Harris NS, Twardziok SO, Pasam RK, Gundlach H, Spannagl M, Ormanbekova D, Lux T, Prade VM, Milner SG, Himmelbach A, Mascher M, Bagnaresi P, Faccioli P, Cozzi P, Lauria M, Lazzari B, Stella A, Manconi A, Gnocchi M, Moscatelli M, Avni R, Deek J, Biyiklioglu S, Frascaroli E, Corneti S, Salvi S, Sonnante G, Desiderio F, Marè C, Crosatti C, Mica E, Özkan H, Kilian B, De Vita P, Marone D, Joukhadar R, Mazzucotelli E, Nigro D, Gadaleta A, Chao S, Faris JD, Melo ATO, Pumphrey M, Pecchioni N, Milanesi L, Wiebe K, Ens J, MacLachlan RP, Clarke JM, Sharpe AG, Koh CS, Liang KYH, Taylor GJ, Knox R, Budak H, Mastrangelo AM, Xu SS, Stein N, Hale I, Distelfeld A, Hayden MJ, Tuberosa R, Walkowiak S, Mayer KFX, Ceriotti A, Pozniak CJ, Cattivelli L

Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets

(2019) in Nature genetics (Print)
Maccaferri, Marco; Harris, Neil S.; Twardziok, Sven O.; Pasam, Raj K.; Gundlach, Heidrun; Spannagl, Manuel; Ormanbekova, Danara; Lux, Thomas; Prade, Verena M.; Milner, Sara G.; Himmelbach, Axel; Mascher, Martin; Bagnaresi, Paolo; Faccioli, Primetta; Cozzi, Paolo; Lauria, Massimiliano; Lazzari, Barbara; Stella, Alessandra; Manconi, Andrea; Gnocchi, Matteo; Moscatelli, Marco; Avni, Raz; Deek, Jasline; Biyiklioglu, Sezgi; Frascaroli, Elisabetta; Corneti, Simona; Salvi, Silvio; Sonnante, Gabriella; Desiderio, Francesca; Mare, Caterina; Crosatti, Cristina; Mica, Erica; Ozkan, Hakan; Kilian, Benjamin; De Vita, Pasquale; Marone, Daniela; Joukhadar, Reem; Mazzucotelli, Elisabetta; Nigro, Domenica; Gadaleta, Agata; Chao, Shiaoman; Faris, Justin D.; Melo, Arthur T. O.; Pumphrey, Mike; Pecchioni, Nicola; Milanesi, Luciano; Wiebe, Krystalee; Ens, Jennifer; MacLachlan, Ron P.; Clarke, John M.; Sharpe, Andrew G.; Koh, Chu Shin; Liang, Kevin Y. H.; Taylor, Gregory J.; Knox, Ron; Budak, Hikmet; Mastra...

Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets

(2019) in Nature genetics (Print)
Armano G1, Fotia G2, Manconi A3.

BITS 2017: the annual meeting of the Italian Society of Bioinformatics

(2018) in BMC bioinformatics
Moscatelli, Marco; Manconi, Andrea; Pessina, Mauro; Fellegara, Giovanni; Rampoldi, Stefano; Milanesi, Luciano; Casasco, Andrea; Gnocchi, Matteo

An infrastructure for precision medicine through analysis of big data

(2018) in BMC bioinformatics
Andrea Manconi, Emanuele Manca, Alessandro Orro, Giuliano Armano, Matteo Gnocchi, Marco Moscatelli and Luciano Milanesi

G-CNV: A GPU-based Tool for Preparing Data to Detect CNVs with Read Depth Methods

(2015) in Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
Manconi, Andrea; Manca, Emanuele; Moscatelli, Marco; Gnocchi, Matteo; Orro, Alessandro; Armano, Giuliano; Milanesi, Luciano

G-CNV: A GPU-Based Tool for Preparing Data to Detect CNVs with Read-Depth Methods.

(2015) in Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
Manconi, Andrea; Orro, Alessandro; Manca, Emanuele; Armano, Giuliano; Milanesi, Luciano

A tool for mapping Single Nucleotide Polymorphisms using Graphics Processing Units

(2014) in BMC bioinformatics
Manconi, Andrea; Orro, Alessandro; Manca, Emanuele; Armano, Giuliano; Milanesi, Luciano

GPU-BSM: A GPU-Based Tool to Map Bisulfite-Treated Reads

(2014) in PloS one
Silvia Santoro1, Pasqualina D'Ursi1, Nadia Galluccio1, Martina Landini1, Alessandra Mezzelani1, Alessandro Orro1, John Hatton1, Matteo Gnocchi1, Andrea Manconi1 and Luciano Milanesi1*

Bioinformatics molecular dynamics and docking pipeline analysis for high-throughput genome analysis and drug discovery oriented to personalized pain therapy in non-responsive patients.

(2013) Front. Neuroinform. Conference, Stockholm, Sweden, 27-29 agosto 2013
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