Andreas Gisel

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Andreas Gisel è un bioinformatico con diploma e dottorato di ricerca in scienze naturali (specializzato in biologia molecolare) presso l'Istituto Federale Svizzero di Tecnologia di Zurigo, Svizzera. Ha più di 10 anni di esperienza in biologia molecolare accumulata durante il suo dottorato di ricerca, lavorando per 4 anni alla UC Berkeley, USA e 2 anni al Friedrich Miescher Institute (una fondazione Novartis) a Basilea, in Svizzera. Nel tempo si è specializzato in bioinformatica lavorando presso Novartis SA a Basilea, Svizzera, concentrandosi sulla ricerca sul cancro e infine presso l'Istituto per le tecnologie biomediche, Bari, Italia, specializzato in interazione pianta-virus. Negli ultimi 20 anni ha sviluppato competenze nell'analisi dei dati di sequenze di nuova generazione, database biologici e ha anche una lunga esperienza nell'insegnamento. Ha lavorato per 3 anni presso l'International Institute of Tropical Agriculture (IITA), Ibadan, Nigeria e continua a offrire consulenza fino ad oggi. Durante questo periodo all'IITA ha lavorato con manioca, igname e mais all'analisi dell'espressione genica. È stato responsabile di diversi progetti sul miglioramento della manioca e sull'analisi delle caratteristiche molecolari per proporre approcci biotecnologici per aumentare la resa, il contenuto di amido e la resistenza ai virus e per migliorare la qualità del cibo mediante biofortificazione.

Aree di interesse:

Analisi dei dati NGS come: - risequenziamento e assemblaggio dell'intero genoma - Analisi dei dati RNA-seq inclusa l'espressione genica, lo splicing alternativo e l'espressione specifica del allele - analisi dei dati di smallRNA non codificante - Analisi di metilazione del DNA


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Prodotti della ricerca

Obata T., Klemens P.A.W., Rosado-Souza L., Schlereth A., Gisel A., Stavolone L., Zierer W., Morales N., Mueller L.A., Zeeman S.C., Ludewig F., Stitt M., Sonnewald U., Neuhaus H.E., Fernie A.R.

Metabolic profiles of six African cultivars of cassava (Manihot esculenta Crantz) highlight bottlenecks of root yield

(2020) in Plant journal (Print)
Toshihiro Obata Patrick A.W. Klemens Laise Rosado-Souza Armin Schlereth Andreas Gisel* Livia Stavolone* Wolfgang Zierer Nicolas Morales Lukas A. Mueller Samuel C. Zeeman Frank Ludewig Mark Stitt Uwe Sonnewald H. Ekkehard Neuhaus Alisdair R. Fernie

Metabolic profiles of six African cultivars of cassava (Manihot esculenta Crantz) highlight bottlenecks of root yield

Toshihiro Obata Patrick A.W. Klemens Laise Rosado-Souza Armin Schlereth Andreas Gisel* Livia Stavolone* Wolfgang Zierer Nicolas Morales Lukas A. Mueller Samuel C. Zeeman Frank Ludewig Mark Stitt Uwe Sonnewald H. Ekkehard Neuhaus (2019) in Plant journal (Online)
Chisom Ezekannagha, Andreas Gisel, Angela Makolo

A Computational Pipeline for Genome Annotation and Metabolic Pathway Reconstruction in Plants (A case study of Cassava)

(2019) First Nigerian Bioinformatics Conference (FNBC), Lagos, Nigeria, 06/25/2019, 06/26/2019
Temitayo Olagunju, Chisom Ezekannagha, Damilola Dada, Ismail Rabbi, Melaku Gedil, Livia Stavolone, Andreas Gisel

In depth investigation of gene regulation mechanisms for virus defense in Cassava

(2019) First Nigerian Bioinformatics Conference (FNBC), Lagos, Nigeria, 06/25/2019, 06/26/2019
Temitayo A. Olagunju, Angela U. Makolo, Andreas Gisel

Multi-layer Networks: Prospects in Study of Small RNA-mediated Gene Regulatory Network of Cassava in Diseased Condition

(2019) First Nigerian Bioinformatics Conference (FNBC),, Lagos, Nigeria, 06/25/2019,-06/26/2019
Brandon H; Raheemat SO; Carluccio AV; David L; Abdulsalam T; Stavolone L; Gisel A

Dissecting cassava root bulking

(2017) THE 13TH INTERNATIONAL SYMPOSIUM OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR TROPICAL ROOT CROPS-AFRICA BRANCH (ISTRC-AB);, Dar Salam, Tanzania, 03/05/2017, 03/10/2017
Melaku Gedil Morag Ferguson Gezahegn Girma Andreas Gisel Livia Stavolone Ismail Rabbi

Perspectives on the application of next-generation sequencing to the improvement of Africa's staple food crops

Melaku Gedil Morag Ferguson Gezahegn Girma Andreas Gisel Livia Stavolone (2016) in Next Generation Sequencing - Advances, Applications and Challenges, 2016
Giorgio De Caro 1, Arianna Consiglio 1, Domenica D'Elia 1?, Andreas Gisel 1,2, Giorgio Grillo 1, Sabino Liuni 1, Angelica Tulipano 1, Flavio Licciulli 1

The NonCode aReNA DB: a non-redundant and integrated collection of non- codingRNAs

(2015) in EMBnet journal
Flores R., Minoia S., Carbonell A., Gisel A., Delgado S., Lopez-Carrasco A., Navarro B., Di Serio F.

Viroids, the simplest RNA replicons: How they manipulate their hosts for being propagated and how their hosts react for containing the infection

(2015) in Virus research (Print)
Giorgio De Caro1, Arianna Consiglio1, Domenica D'Elia1, Andreas Gisel1, Giorgio Grillo1, Sabino Liuni1, Angelica Tulipano1 and Flavio Licciulli1

NonCode aReNA DB: a non-redundant and integrated collection of non-coding RNAs

(2015) BITS 2015 Twelfth Annual Meeting of the Bioinformatics Italian Society, Milan, 3-5 Giugno 2015
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