Clarissa Consolandi

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La sottoscritta ha accumulato vasta esperienza in biologia molecolare e biotecnologie, focalizzando l'attenzione principalmente su piattaforme microarray, di sequenziamento ultra-massivo e a singola-cellula nei settori della Genomica, Trascrittomica e Metagenomica con applicazioni in diversi campi scientifici (patologie umane, microbiologia). Si occupa di: - Attività di sequenziamento a singola-cellula mediante la piattaforma 10X Genomics per la caratterizzazione degli stati molecolari delle cellule mediante i loro profili trascrizionali - Attività di sequenziamento ultra-massivo, mediante le piattaforme Illumina e Roche, per l'analisi di: ° metagenomi [Microbioma Umano (intestinale, nasale, orale, vaginale, rettale); °Microbioma Animale (studi in modelli di topo; in delfini come peculiare configurazione microbioma-ospite); Microbioma ambientale (controllo delle acque, studio delle croste del suolo); °Trascrittomi di Procarioti ed Eucarioti; °Interi genomi procariotici; °Particolari regioni d'interesse in genomi umani in relazione a patologie °Interazione ospite/patogeno °Interazione ospite/comunità microbica Buone capacità comunicative acquisite durante le attività didattiche e accademiche, mediante la partecipazione a Congressi nazionali e internazionali, all'organizzazione di congressi nazionali, durante le lezioni agli studenti delle università e delle scuole di dottorato. Le competenze organizzative e manageriali sono acquisite grazie al ruolo di Responsabile Scientifico a diversi Progetti finanziati dal Ministero Italiano dell'Università e Ricerca, dalla Fondazione Cariplo e dalla Regione Lombardia, dimostrando grande capacità di lavorare in team.

Aree di interesse:

Tecnologie Omiche: Genomica, Trascrittomica, Metagenomica applicate in diversi settori (patologie umane; studio di microorganismi)


Contatti

Telefono: 0226422764
Skype: clarissa.consolandi

Identificatori Internazionali


H-index

Google Scholar H-Index: 31
Scopus H-Index: 26
ISI-WoS H-Index: 23

Esperienze lavorative

Ricercatore III livello III fascia
Datore di lavoro: ITB - Istituto di tecnologie biomediche
Frequenza: 02/2004 - oggi

-Attività di sequenziamento a singola-cellula mediante la piattaforma 10X Genomics per la caratterizzazione degli stati molecolari delle cellule mediante i loro profili trascrizionali -Attività di sequenziamento ultra-massivo, mediante le piattaforme Illumina e Roche, per l'analisi di: °metagenomi [Microbioma Umano (intestinale, nasale, orale, vaginale, rettale); Microbioma Animale (studi in modelli di topo; in delfini come peculiare configurazione microbioma-ospite); Microbioma ambientale (controllo delle acque, studio delle croste del suolo); °Trascrittomi di Procarioti ed Eucarioti; °Interi genomi procariotici; °Particolari regioni d'interesse in genomi umani in ralazione a patologie °Interazione ospite/patogeno °Interazione ospite/comunità microbica



Formazione

Dottorato di Ricerca in Medicina Molecolare
Dottorato
Università degli Studi di Milano - via F.lli Cervi 93 Segrate (Mi)
Area disciplinare: Genomics, Proteomics and Tecnologie correlate
Data conseguimento: 2004-01-16
Tesi: "Development of DNA Microarrays for human single nucleotide polymorphisms detection"

Laurea in Scienze Biologiche
Laurea (Vecchio Ordinamento)
Università degli Studi di Milano - via Celoria Milano
Area disciplinare: Biologia Molecolare
Data conseguimento: 2000-07-21
Tesi: Sviluppo della Tecnologia dei DNA Microarrays per lo studio di mutazioni e l'identificazione di polimorfismi


Lingue

Produzione Comprensione
Scritta Orale Scritta Orale Note
Inglese - Conoscenza professionaleB2B1B2B1

Periodo di training di due mesi presso il Molecular Medicine Group del Research Department of Uppsala University Hospital (Uppsala, Sweden), sotto la supervisione del Prof. Ann-Christine Syvänen, nell'ambito del progetto "Minisequencing-primer extension technology applied to a tag-array format".


Competenze

GENOMICS
HUMAN DISEASES
METAGENOMICS
MICROBIOME
TRASCRIPTOMICS

Research activities classification (ERC)

GENETICS, GENOMICS, BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY: GENETICS, POPULATION GENETICS, MOLECULAR GENETICS, GENOMICS, TRANSCRIPTOMICS, PROTEOMICS, METABOLOMICS, BIOINFORMATICS, COMPUTATIONAL BIOLOGY, BIOSTATISTICS, BIOLOGICAL MODELLING AND SIMULATION, SYSTEMS BIOLOGY, GENETIC EPIDEMIOLOGY
LIFE SCIENCES

Prodotti della ricerca

Andrea Baragetti , Marco Severgnini , Elena Olmastroni , Carola Conca Dioguardi , Elisa Mattavelli , Andrea Angius , Luca Rotta , Javier Cibella , Giada Caredda , Clarissa Consolandi , Liliana Grigore , Fabio Pellegatta , Flavio Giavarini , Donatella Caruso , Giuseppe Danilo Norata , Alberico Luigi Catapano and Clelia Peano

Gut Microbiota Functional Dysbiosis Relates to Individual Diet in Subclinical Carotid Atherosclerosis

Andrea Baragetti , Marco Severgnini , Elena Olmastroni , Carola Conca Dioguardi , Elisa Mattavelli , Andrea Angius , Luca Rotta , Javier Cibella , Giada Caredda , Clarissa Consolandi , Liliana Grigore , Fabio Pellegatta , Flavio Giavarini , Donatella Caruso , Giuseppe Danilo Norata , Alberico Luigi Catapano (2021) in Nutrients
Spreafico M.; Mangano E.; Mazzola M.; Consolandi C.; Bordoni R.; Battaglia C.; Bicciato S.; Marozzi A.; Pistocchi A.

The Genome-wide impact of Nipblb loss-of-function on Zebrafish gene expression

(2020) in International journal of molecular sciences (Print)
van der Houwen, Tim B.; van Laar, Jan A. M.; Kappen, Jasper H.; van Hagen, Petrus M.; de Zoete, Marcel R.; van Muijlwijk, Guus H.; Berbers, Roos-Marijn; Fluit, Ad C.; Rogers, Malbert; Groot, James; Hazelbag, C. Marijn; Consolandi, Clarissa; Severgnini, Marco; Peano, Clelia; D'Elios, Mario M.; Emmi, Giacomo; Leavis, Helen L.

Behcet's Disease Under Microbiotic Surveillance? A Combined Analysis of Two Cohorts of Behcet's Disease Patients

(2020) in Frontiers in immunology
Lopetuso, Loris Riccardo; Severgnini, Marco; Pecere, Silvia; Ponziani, Francesca Romana; Boskoski, Ivo; Larghi, Alberto; Quaranta, Gianluca; Masucci, Luca; Ianiro, Gianluca; Camboni, Tania; Gasbarrini, Antonio; Costamagna, Guido; Consolandi, Clarissa; Cammarota, Giovanni

Esophageal microbiome signature in patients with Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma

(2020) in PloS one
Marangoni A, Ceccarani C, Camboni T, Consolandi C, Foschi C, Salvo M, Gaspari V, D'Antuono A, Belletti M, Re MC, Severgnini M.

Pharyngeal microbiome alterations during Neisseria gonorrhoeae infection

(2020) in PloS one
Ianiro G.; Rossi E.; Thomas A.M.; Schinzari G.; Masucci L.; Quaranta G.; Settanni C.R.; Lopetuso L.R.; Armanini F.; Blanco-Miguez A.; Asnicar F.; Consolandi C.; Iacovelli R.; Sanguinetti M.; Tortora G.; Gasbarrini A.; Segata N.; Cammarota G.

Faecal microbiota transplantation for the treatment of diarrhoea induced by tyrosine-kinase inhibitors in patients with metastatic renal cell carcinoma

(2020) in Nature communications
Verrillo, Lucia and Mangano, Eleonora and Drongitis, Denise and Merelli, Ivan and Pischedda, Francesca and Piccoli, Giovanni and Consolandi, Clarissa and Bordoni, Roberta and Miano, Maria Giuseppina

A reliable strategy for single-cell RNA sequencing analysis using cryoconserved primary cortical cells.

(2020) in Journal of neuroscience methods
Ceccarani, Camilla; Foschi, Claudio; Parolin, Carola; D'Antuono, Antonietta; Gaspari, Valeria; Consolandi, Clarissa; Laghi, Luca; Camboni, Tania; Vitali, Beatrice; Severgnini, Marco; Marangoni, Antonella

Diversity of vaginal microbiome and metabolome during genital infections

(2019) in Scientific reports (Nature Publishing Group)
Ceccarani, Camilla; Marangoni, Antonella; Severgnini, Marco; Camboni, Tania; Laghi, Luca; Gaspari, Valeria; D'Antuono, Antonietta; Foschi, Claudio; Re, Maria Carla; Consolandi, Clarissa

Rectal Microbiota Associated With Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae Infections in Men Having Sex With Other Men

(2019) in Frontiers in cellular and infection microbiology
Barichella M1, Severgnini M2, Cilia R1, Cassani E1, Bolliri C1, Caronni S1, Ferri V1, Cancello R3, Ceccarani C2,4, Faierman S1, Pinelli G1,5, De Bellis G2, Zecca L2,6, Cereda E7, Consolandi C2, Pezzoli G1.

Unraveling gut microbiota in Parkinson's disease and atypical parkinsonism

(2019) in Movement disorders
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