Gabriele Antonio Trombetti

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Gabriele A. Trombetti ha conseguito la laurea in Ingegneria Informatica V.O. (5 anni) con 100/100 e lode presso l'Università di Bologna nel 2004, con una tesi su modellazione e validazione per sistemi distribuiti real-time sviluppata presso la Vanderbilt University, Nashville, TN, USA. Successivamente ha conseguito il dottorato di ricerca nel 2008 presso l'Università di Bologna, con un lavoro sul supporto delle applicazioni bioinformatiche per la piattaforma europea di Grid Computing EGEE. Attualmente lavora nell'Istituto di Tecnologie Biomediche del CNR con ricerche nel campo delle simulazioni di dinamica molecolare per proteine di membrana, bioinformatica strutturale per il drug discovery e previsioni in silico per malattie mutazionali. Inoltre, sta lavorando su tecniche per aumentare il throughput delle simulazioni MD tramite approssimazioni del calcolo accuratamente selezionate. In precedenza sempre a CNR-ITB ha lavorato nell'ingegneria dei sistemi informatici per il calcolo nei problemi di bioinformatica, HPC, sistemi di storage ad alte prestazioni, grid computing e GPU computing.

Aree di interesse:

bioinformatica strutturale, docking e dinamica molecolare, drug discovery, meccanismi molecolari


Contatti

Telefono: 02 26422608

Identificatori Internazionali


Prodotti della ricerca

Rusnati, Marco; Sala, Davide; Orro, Alessandro; Bugatti, Antonella; Trombetti, Gabriele; Cichero, Elena; Urbinati, Chiara; Di Somma, Margherita; Millo, Enrico; Galietta, Luis J. V.; Milanesi, Luciano; Fossa, Paola; D'Ursi, Pasqualina

Speeding Up the Identification of Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator-Targeted Drugs: An Approach Based on Bioinformatics Strategies and Surface Plasmon Resonance.

(2018) in Molecules (Basel, Online)
D'Ursi, Pasqualina; Guariento, Sara; Trombetti, Gabriele; Orro, Alessandro; Cichero, Elena; Milanesi, Luciano; Fossa, Paola; Bruno, Olga

Further Insights in the Binding Mode of Selective Inhibitors to Human PDE4D Enzyme Combining Docking and Molecular Dynamics

(2016) in Molecular informatics (Print)
Pasqualina D'Ursi a*, Alessandro Orro a, Giulia Morra b, Marco Moscatelli ac, Gabriele Trombetti a, Luciano Milanesi a & Ermanna Rovida d*

Molecular dynamics and docking simulation of a natural variant of Activated Protein C with impaired protease activity: implications for integrin-mediated antiseptic function.

(2015) in Journal of biomolecular structure and dynamics (Online)
D'Ursi P., Orro A., Trombetti G., Milanesi L.

Long Molecular Dynamics on GPUs infrastructure establish key residues and the binding mode of the inhibitors of the phosphodiesterase superfamily.

(2013) 1° Bioinformatics, computational Biology and System Biology lombardy day BioLom 2013, Milano, 27 novembre 2013
Calabria A., Di Pasquale D., Gnocchi M., Cozzi P., Orro A., Trombetti G., Milanesi L.

Grid Powered Genome Wide Studies On Atrial Flutter

(2010) in Journal of grid computing
Calabria A., Di Pasquale D., Gnocchi M., Cozzi P.A., Orro A., Trombetti G.A., Milanesi L.

Grid Based Genome Wide Studies on Atrial Flutter.

(2010)
Federica Torri; Anna Akelai; Sara Lupoli; Manuela Sironi; Daniela Amann-Zalcenstein; Matteo Fumagalli; Chiara Dal Fiume; Edna Ben-Asher; Kyra Kanyas; Rachele Cagliani; Paolo Cozzi; Gabriele Trombetti; Luisa Strik Lievers; Erika Salvi; Alessandro Orro; Jacques S. Beckmann; Doron Lancet; Yoav Kohn; Luciano Milanesi; Richard B. Ebstein; Bernard Lerer; Fabio Macciardi

Fine mapping of AHI1 as a schizophrenia susceptibility gene: from association to evolutionary evidence

(2010) in The FASEB journal
Milanesi L., Calabria A., Di Pasquale D., Orro A., Trombetti G.

A HPC and Grid Enabling Framework for Genetic Linkage Analysis of SNPs

(2009) in Il Nuovo cimento (Online)
Calabria A., Di Pasquale D., Orro A., Trombetti G., Gnocchi M., Milanesi L.

Genetic linkage analysis challenge on a distributed Grid environment

(2009) in VOGiS Herald
Calabria A., Di Pasquale D., Orro A., Trombetti G., Gnocchi M., Milanesi L.

Grid Based Application For SNPs Genome Wide Studies

(2009) CIBB 2009, Sixth International Meeting On Computational Intelligence Methods for Bioinformatics And Biostatistics
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