Giorgio Grillo

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Giorgio Grillo si è laureato in Scienze dell'Informazione nel 1993 presso l'Università degli Studi di Bari Aldo Moro con una tesi nell'ambito del Calcolo Parallelo applicato agli Algoritmi per l'analisi di sequenze biologiche. Ha iniziato a collaborare dal 1994 con il gruppo di Bioinformatica del CNR di Bari nello sviluppo di software per Genomica e Trascrittomica e nel 2001 è diventato Tecnologo del CNR presso Istituto di Tecnologie Biomediche (ITB) sede di Bari. Le attività di ricerca di maggior rilievo sono: disegno, sviluppo e gestione di database biologici specializzati, punti di riferimento a livello internazionale (UTRdb/UTRsite, MitoNuc/MitoRes, p53FamTag e PlantPis); sviluppo di metodologie e implementazione di algoritmi per l'analisi e l'annotazione funzionale delle sequenze biologiche, ampiamente utilizzati dalla comunità scientifica (CleanUp, PatSearch, CSTminer e GeneUp). Negli ultimi anni ha intrapreso lo studio e la messa a punto di sistemi per la gestione, integrazione e annotazione strutturale/funzionale di dati "omici" prodotti dalle piattaforme di Next Generation Sequencing (NGS). Si è specializzato nella costruzione di complesse pipeline/workflow in molteplici ambiti di analisi e nell'implementazione di Web Applications e Web Tools. Ha partecipato a numerosi progetti di ricerca sia nazionali che internazionali ed è autore/coautore di circa 40 articoli su riviste internazionali nel settore della Bioinformatica.

Aree di interesse:

Competenze in Bioinformatica: progettazione e implementazione di algoritmi e pipeline per l'analisi bioinformatica; progettazione e sviluppo di database bioinformatici e applicazioni per la loro gestione; realizzazione di Web application e Web server per workflow bioinformatici; analisi di dati di Genomica, Trascrittomica e Metagenomica, in particolare da dati prodotti da tecnologie di Next-Generation Sequencing (NGS).


Contatti

Telefono: 0805929667

Identificatori Internazionali

Scopus Author ID: 7005064931
WoS Researcher ID: F-7617-2015

Prodotti della ricerca

Puccio S.; Grillo G.; Consiglio A.; Soluri M.F.; Sblattero D.; Cotella D.; Santoro C.; Liuni S.; Bellis G.; Lugli E.; Peano C.; Licciulli F.

InteractomeSeq: a web server for the identification and profiling of domains and epitopes from phage display and next generation sequencing data

(2020) in Nucleic acids research (Online)
Nicoletta Nuzziello, Francesco Craig, Marta Simone, Arianna Consiglio, Flavio Licciulli, Lucia Margari, Giorgio Grillo, Sabino Liuni, Maria Liguori

Integrated analysis of microRNA and mRNA expression profiles reveals a complex interaction network in Attention Deficit Hyperactivity Disorder

(2019) in Brain sciences
Liguori M1, Nuzziello N1,2, Licciulli F1, Consiglio A1, Simone M2, Viterbo RG2, Creanza TM3, Ancona N3, Tortorella C2,4, Margari L2, Grillo G1, Giordano P5, Liuni S1, Trojano M2.

Combined microRNA and mRNA expression analysis in pediatric multiple sclerosis: an integrated approach to uncover novel pathogenic mechanisms of the disease.

(2018) in Human molecular genetics (Print)
Balech, Bachir; Sandionigi, Anna; Manzari, Caterina; Trucchi, Emiliano; Tullo, Apollonia; Licciulli, Flavio; Grillo, Giorgio; Sbisa, Elisabetta; De Felici, Stefano; Saccone, Cecilia; D'Erchia, Anna Maria; Cesaroni, Donatella; Casiraghi, Maurizio; Vicario, Saverio

Tackling critical parameters in metazoan meta-barcoding experiments: a preliminary study based on coxI DNA barcode

(2018) in PeerJ
Soluri, Maria Felicia; Puccio, Simone; Caredda, Giada; Grillo, Giorgio; Licciulli, Vito Flavio; Consiglio, Arianna; Edomi, Paolo; Santoro, Claudio; Sblattero, Daniele; Peano, Clelia

Interactome-Seq: A Protocol for Domainome Library Construction, Validation and Selection by Phage Display and Next Generation Sequencing

(2018) in Journal of visualized experiments
Santamaria, Monica; Fosso, Bruno; Licciulli, Flavio; Balech, Bachir; Larini, Ilaria; Grillo, Giorgio; De Caro, Giorgio; Liuni, Sabino; Pesole, Graziano

ITSoneDB: a comprehensive collection of eukaryotic ribosomal RNA Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) sequences.

(2017) in Nucleic acids research (Online)
Liguori, Maria; Nuzziello, Nicoletta; Licciulli, Flavio; Consiglio, Arianna; Simone, Marta; Gemma Viterbo, Rosa; Creanza, Teresa Maria; Ancona, Nicola; Tortorella, Carla; Margari, Lucia; Grillo, Giorgio; Giordano, Paola; Liuni, Sabino; Trojano, Maria

Combined microRNAs and mRNAs expression analysis in Pediatric Multiple Sclerosis: an integrated approach to uncover novel pathogenic mechanisms of the disease.

(2017) in Human molecular genetics online
Puccio, Simone; Grillo, Giorgio; Licciulli, Flavio; Severgnini, Marco; Liuni, Sabino; Bicciato, Silvio; De Bellis, Gianluca; Ferrari, Francesco; Peano, Clelia

WoPPER: Web server for Position Related data analysis of gene Expression in Prokaryotes.

(2017) in Nucleic acids research
Consiglio, Arianna; Mencar, Corrado; Grillo, Giorgio; Marzano, Flaviana; Caratozzolo, Mariano Francesco; Liuni, Sabino

A fuzzy method for RNA-Seq differential expression analysis in presence of multireads

(2016) in BMC bioinformatics
Consiglio A.; Mencar C.; Grillo G.; Liuni S.

Managing NGS differential expression uncertainty with fuzzy sets

(2016) in , 2016
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