Marco Severgnini

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Ha iniziato a lavorare nell'ambito della ricerca occupandosi della messa a punto di protocolli di deposizione ed analisi dati di microarray custom a bassa/media densità per l'analisi di genotipizzazione. Attualmente, lavora in qualità di bioinformatico nel gruppo di Genomica dell'Istituto di Tecnologie Biomediche, con particolare riferimento all'analisi di dati da sequenziamento ultramassivo (NGS)

Aree di interesse:
  • Analisi di microbiota in stati fisiologici/patologici ed interazione con l'ospite
  • Analisi di riarrangiamenti strutturali del genoma
  • Analisi di short-tandem repeats

Contatti

Telefono: +39 02 26422705
Recapito: via f.lli Cervi, 93, Segrate (MI), Italy

Identificatori Internazionali

Scopus Author ID: 12798920900
WoS Researcher ID: F-5832-2013
Google Scholar: C-hw6ZEAAAAJ

H-index

Google Scholar H-Index: 29
Scopus H-Index: 25
ISI-WoS H-Index: 23

Esperienze lavorative

Ricercatore a tempo indeterminato (III° livello)
Datore di lavoro: CNR - Consiglio Nazionale delle Ricerche - via fratelli Cervi, 93, Segrate (MI)
Sito web ente: http://www.itb.cnr.it
Frequenza: 12/2009 - oggi
  • Analisi bioinformatiche di dati di Next Generation Sequencing nell'ambito della caratterizzazione di ecosistemi complessi (microbiota intestinale nell'adulto e nel neonato, nonché associato a diverse patologie)
  • Analisi bioinformatiche di dati di Next Generation Sequencing nell'ambito della determinazione di varianti strutturali in patologie tumorali (leucemia acuta infantile, leucemia mieloide acuta)
  • Analisi bioinformatiche di dati di Next Generation Sequencing nell'ambito dell'analisi dei punti di integrtazione di vettori retrovirali (HIV, ASLV, MLV)

Ricercatore a tempo determinato (art. 23)
Datore di lavoro: CNR - Consiglio Nazionale delle Ricerche - via fratelli Cervi, 93, Segrate (MI)
Sito web ente: http://www.itb.cnr.it
Frequenza: 04/2008 - 12/2009
  • Sviluppo di piattaforme ad array per la caratterizzazione di ecosistemi complessi (es: microbiota umano) e per la sicurezza alimentare (identificazione di patogeni nel latte e nei prodotti ittici)
  • Analisi bioinformatica di dati di Next Generation Sequencing per la determinazione delle basi molecolari di malattie genetiche umane (distrofina, cancro al colon)

Contratto di Collaborazione Coordinata a Progetto
Datore di lavoro: CNR - Consiglio Nazionale delle Ricerche - via fratelli Cervi, 93, Segrate (MI)
Sito web ente: http://www.itb.cnr.it
Frequenza: 11/2006 - 03/2008
  • Sviluppo di metodologie di indagine molecolare a DNA, basate su tecnologie ad array e di metodiche di elaborazione dati correlate
  • Utilizzo e sviluppo di piattaforme integrate tipo lab-on-chip per l'analisi di genotipizzazione.
  • Analisi dati applicata a tecnologie ad array ad alta densità, nel campo dell'analisi di espressione differenziale.

Assegnista di ricerca
Datore di lavoro: CNR - Consiglio Nazionale delle Ricerche - via fratelli Cervi, 93, Segrate (MI)
Sito web ente: http://www.itb.cnr.it
Frequenza: 02/2004 - 10/2006
  • Applicazione delle tecniche di Design of Experiments per il controllo qualitativo ed il miglioramento di protocolli di biologica molecolare
  • Ottimizzazione di protocolli di produzione di microarray
  • Analisi statistica di dati microarray, nell'ambito di progetti di genotipizzazione a media/bassa risoluzione.


Attività

Partecipazione a gruppi di lavoro, commissioni o organismi

Consiglio d'Istituto ITB-CNR

Posizione lavorativa: Ricercatore a tempo indeterminato (III° livello)
Ruolo: Consigliere
Perodo di partecipazione all'attività: 07/2017 - oggi
Organizzazioni coinvolte: ITB - ISTITUTO DI TECNOLOGIE BIOMEDICHE;

Incarichi di tutor per tesi

Caratterizzazione del microbiota del tratto gastrointestinale nella malattia di Parkinson tramite analisi bioinformatica di dati metagenomici

Posizione lavorativa: Ricercatore a tempo indeterminato (III° livello)
Ruolo: Tutor esterno
Perodo di partecipazione all'attività: 10/2015 - 09/2016
Organizzazioni coinvolte: ITB - ISTITUTO DI TECNOLOGIE BIOMEDICHE; UNIMI - DIPARTIMENTO DI BIOSCIENZE;

Formazione

Laurea in Ingegneria Biomedica (vecchio ordinamento)
Laurea (Vecchio Ordinamento)
Politecnico di Milano - piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano
Area disciplinare: ingegneria biomedica
Votazione: 93/100
Data conseguimento: 2003-12-19
Frequenza: 09/1997 - 12/2003
Tesi: Applicazione dei metodi di Taguchi all'analisi del processo di fabbricazione di DNA microarrays

Tesi di Laurea svolta nell'ambito di uno stage formativo di 7 mesi presso l'Istituto di Tecnologie Biomediche del CNR di Segrate (MI)


Esame di stato per l'abilitazione all'esercizio della professione di Ingegnere
Altro
Politecnico di Milano - piazza Leonardo da Vinci, 32, Milano
Area disciplinare: ingegneria biomedica
Votazione: 91/100


Competenze

BIOINFORMATICA
DNA MICROARRAYS
MICROBIOMA
SEQUENZIAMENTO ULTRAMASSIVO

Research activities classification (ERC)

BIOINFORMATICS
GENETICS, GENOMICS, BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY: GENETICS, POPULATION GENETICS, MOLECULAR GENETICS, GENOMICS, TRANSCRIPTOMICS, PROTEOMICS, METABOLOMICS, BIOINFORMATICS, COMPUTATIONAL BIOLOGY, BIOSTATISTICS, BIOLOGICAL MODELLING AND SIMULATION, SYSTEMS BIOLOGY, GENETIC EPIDEMIOLOGY
GENOMICS, COMPARATIVE GENOMICS, FUNCTIONAL GENOMICS
LIFE SCIENCES
TRANSCRIPTOMICS

Classificazione attività di ricerca (ATECO)

RICERCA SCIENTIFICA E SVILUPPO

Curriculum Vitae


Prodotti della ricerca

Andrea Baragetti , Marco Severgnini , Elena Olmastroni , Carola Conca Dioguardi , Elisa Mattavelli , Andrea Angius , Luca Rotta , Javier Cibella , Giada Caredda , Clarissa Consolandi , Liliana Grigore , Fabio Pellegatta , Flavio Giavarini , Donatella Caruso , Giuseppe Danilo Norata , Alberico Luigi Catapano and Clelia Peano

Gut Microbiota Functional Dysbiosis Relates to Individual Diet in Subclinical Carotid Atherosclerosis

Andrea Baragetti , Marco Severgnini , Elena Olmastroni , Carola Conca Dioguardi , Elisa Mattavelli , Andrea Angius , Luca Rotta , Javier Cibella , Giada Caredda , Clarissa Consolandi , Liliana Grigore , Fabio Pellegatta , Flavio Giavarini , Donatella Caruso , Giuseppe Danilo Norata , Alberico Luigi Catapano (2021) in Nutrients
Tolomeo, Doron; Agostini, Antonio; Macchia, Gemma; L'Abbate, Alberto; Severgnini, Marco; Cifola, Ingrid; Frassanito, Maria Antonia; Racanelli, Vito; Solimando, Antonio Giovanni; Haglund, Felix; Mertens, Fredrik; Storlazzi, Clelia Tiziana

BL1391: an established cell line from a human malignant peripheral nerve sheath tumor with unique genomic features

(2021) in Human cell
Federica Prinelli, Nithiya Jesuthasan, Marco Severgnini, Massimo Musicco, Fulvio Adorni, Maria Lea Correa Leite, Chiara Crespi, Sara Bernini.

Exploring the relationship between Nutrition, gUT microbiota, and BRain AgINg in community-dwelling seniors: the Italian NutBrain population-based cohort study protocol

(2020) in BMC geriatrics (Online)
Cremonesi, Paola; Morandi, Stefano; Ceccarani, Camilla; Battelli, Giovanna; Castiglioni, Bianca; Cologna, Nicola; Goss, Andrea; Severgnini, Marco; Mazzucchi, Massimiliano; Partel, Erika; Tamburini, Alberto; Zanini, Lucio; Brasca, Milena

Raw Milk Microbiota Modifications as Affected by Chlorine Usage for Cleaning Procedures: The Trentingrana PDO Case

(2020) in Frontiers in microbiology
van der Houwen, Tim B.; van Laar, Jan A. M.; Kappen, Jasper H.; van Hagen, Petrus M.; de Zoete, Marcel R.; van Muijlwijk, Guus H.; Berbers, Roos-Marijn; Fluit, Ad C.; Rogers, Malbert; Groot, James; Hazelbag, C. Marijn; Consolandi, Clarissa; Severgnini, Marco; Peano, Clelia; D'Elios, Mario M.; Emmi, Giacomo; Leavis, Helen L.

Behcet's Disease Under Microbiotic Surveillance? A Combined Analysis of Two Cohorts of Behcet's Disease Patients

(2020) in Frontiers in immunology
Lopetuso, Loris Riccardo; Severgnini, Marco; Pecere, Silvia; Ponziani, Francesca Romana; Boskoski, Ivo; Larghi, Alberto; Quaranta, Gianluca; Masucci, Luca; Ianiro, Gianluca; Camboni, Tania; Gasbarrini, Antonio; Costamagna, Guido; Consolandi, Clarissa; Cammarota, Giovanni

Esophageal microbiome signature in patients with Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma

(2020) in PloS one
Marangoni A, Ceccarani C, Camboni T, Consolandi C, Foschi C, Salvo M, Gaspari V, D'Antuono A, Belletti M, Re MC, Severgnini M.

Pharyngeal microbiome alterations during Neisseria gonorrhoeae infection

(2020) in PloS one
Paola Cremonesi1, Marco Severgnini2, Alicia Romanò3,4, Mario Luini3, Bianca Castiglioni1

Comparison among four different bacterial DNA extraction protocols for analysing milk metagenomics

(2019) 23° Congresso dell'Associazione per la Scienza e le Produzioni Animali (ASPA), Sorrento, Italy, 11/06/2019, 14/06/2019
Ceccarani, Camilla; Foschi, Claudio; Parolin, Carola; D'Antuono, Antonietta; Gaspari, Valeria; Consolandi, Clarissa; Laghi, Luca; Camboni, Tania; Vitali, Beatrice; Severgnini, Marco; Marangoni, Antonella

Diversity of vaginal microbiome and metabolome during genital infections

(2019) in Scientific reports (Nature Publishing Group)
Elisa Borghi, PhD,1 Valentina Massa, PhD,1 Marco Severgnini, PhD,2 Grazia Fazio, PhD,3 Laura Avagliano, MD,1 Elena Menegola, PhD,4 Gaetano Pietro Bulfamante, MD,1 Giulia Morace, PhD,1 and Francesca Borgo, PhD1

Antenatal Microbial Colonization of Mammalian Gut

(2019) in Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
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